La deuxième génération doit attendre 23 ans avant de voir le jour. La Panda II est sacrée Voiture européenne de l’année en 2004. Longue de 3.54 m, le modèle est proposé uniquement en 5 places. Il est nettement plus léger que ses concurrentes avérées, la Volkswagen Fox et la Renault Twingo 2. Par rapport à la Panda de première génération, la hauteur du pavillon est supérieure de +12 cm, la longueur accuse +13 cm et la largeur +9.5 cm. Une fois la banquette arrière rabattue le volume de rangement peut atteindre 230 litres.

La phase II de 2009 offre une cure de jouvence à la Panda. Elle se traduit par une modification de la façade avant, qui intègre une nouvelle calandre et l’installation de rétroviseurs plus imposants. De nouveaux moteurs performants à faible émission de CO2 sont installés : le 1.2 L 8V 60 ch et le 1.4 L 16V 100 ch permettent des vitesses de pointe de 162 km/h et 185 km/h. Les 0 à 100 km/h sont atteints entre 9.6 sec. et 13.4 sec.

La Panda III est commercialisée en 2012 après avoir été présentée au grand public en septembre 2011 lors du Salon de l’automobile de Francfort. Trois finitions sont disponibles : Pop, Easy et Lounge. La version Easy qui constitue le cœur de la gamme propose un système audio à 6 enceintes, l’ABS, des barres pour pavillon, la direction à assistance électrique et 4 airbags.

Une version quatre roues motrices baptisée Panda cross est commercialisée en 2012. Cette dernière est déclinée en Panda City Cross et en Panda Wild 4X4 en 2017. La version Hybrid débarque en février de l’année 2020 avec une motorisation mild hybrid. Pour les 40 ans du Panda, Fiat décide dépoussiérer son modèle et propose dans son habitacle un écran tactile de 7 pouces compatible avec Apple car Play et Androïd Auto.